Зертхана келесі функцияларды жүзеге асырады

−   ҒЗТКЖ жүргізуне қатысады;

−   ҒЗТКЖ жүргізу бойынша әдістер мен бағдарламаларды, нормативті және технологиялық құжаттар құрып, жетілдіреді;

−   ҒЗТКЖ жүргізуде әдістемелік және консультациялық көмек көрсетеді;

−   маркетинг зерттеу, өнімдердің жаңа үлгілерін, материалдар мен технологиялық процестерді тәжірибелі тексеруде әдістемелік және консультациялық көмек көрсету;

−   жобалық, конструкторлық, іздеушілік және эксперттік жұмыстарды атқарады;

−   жүргізілген жұмыстардың жоғары нәтижелілігін жүзеге асырып, белгіленген тапсырма және бағдарламаларға байланысты ғылыми-зерттеу жұмыстары уақытында және сапалы орындалуына  бақылау жүзеге асырады;

−   Қазақстан Республикасының Заң шығаруымен белгіленген талаптарға сай зияткерлік меншік құқықтарын қорғау, мемлекеттік және коммерциялық құпияларды сақтауды ұстанып, орындалған ҒЗТКЖ жайлы ақпараттарды жинау, сақтау және жүйелеуді қамтамасыз ету;

−   ИБСЗ “МШРКИ” жұмыскерлерінің біліктілігін арттыру, сонымен қатар кадрларды даярлау және қайта даярлауды өткізеді.